Борис Хлебников входит в преподавательский состав Московской школы кино, долгосрочная программа «Режиссура».
Борис Хлебников после окончания школы пошел учиться на биолога в Московский Государственный Педагогический институт, но спустя два года стал студентом сценарно-киноведческого факультета ВГИКа. Во времена учебы Борис снял короткометражный фильм «Мимоход», работая в паре с Алексеем Попогребским. Совместно с этим режиссером Хлебников поставил еще один фильм, на этот раз полнометражный, под названием «Коктебель» в 2003 году. Сценарий этой картины завоевал первое место на конкурсе Европейской киноакадемии в рамках кинофестиваля в Берлине.
Следующий фильм «Свободное плавание» Хлебников выпустил на экраны в 2006 году. За этот фильм он был награжден призом за лучшую режиссуру на фестивале «Кинотавр» в Сочи. Эта лента также принесла талантливому режиссеру еще три премии: «Белый слон» и две Национальные премии кинопрессы и кинокритиков. В 2007 году, работая в паре с Валерией Гай Германикой, Хлебников снимает фильм «Уехал» про историю одного белорусского гастарбайтера.
Его работа над этой лентой дала много полезного материала для следующего его фильма, снятого в 2009 году, под названием «Сумасшедшая помощь». В этом же году на экраны выходит и его короткометражный фильм «Позор». Борис Хлебников принимает участие во многих телевизионных проектах: «Черчилль», «Кинотеатр.doс».
Фильмом Бориса Хлебникова «Пока ночь не разлучит» открылся фестиваль «Кинотавр» В 2012 году. Фильм - задуманная в порядке эксперимента экранизация статьи из «Большого города» с разговорами, подслушанными в ресторане «Пушкин».
В 2012 году премьера социальной драмы «Долгая счастливая жизнь» состоялась на 63-ем Берлинском международном кинофестивале в программе основного конкурса. Фильм получил награды нескольких российских фестивалей.
Борис Хлебников является креативным продюсером телеканале ТНТ, входит в состав отборочной комиссии программы фестиваля «Кинотеатр.doс».